不久，孙文小学毕业后进入当地最高学府读中学。这也是一所教会学校，教师学生都为基督教徒，遵循的也都是基督教义，所以他自然萌生出要加入基督教的想法。
“不可以！”大哥孙眉很生气，他不明白孙文为何有如此荒唐的念头，“千百年来中国人向来信仰佛教，崇尚儒学，怎么能信基督呢。”
“可是，基督教的教义是弘扬以人为善的……”
孙文的话还没说完，就被孙眉粗暴地打断了。
“难道佛教是与人为恶吗？看来我真不该把你送到这种学校去读书。”大哥愤愤地说，他很后悔自己做出的这个选择，本以为到那里去学点文化知识罢了，不成想学校将他引向信仰的邪路上去了。
不久的一天，孙眉对孙文说：“父亲来信说，他年事已高，力不从心，让你回乡照料农务……”
“不要多讲了，这一定是你的主意。”这次孙文也毫不客气地打断大哥的话，脸上浮现鄙夷不屑的表情，“其实我也想早点回家。”
孙眉看着孙文脸色铁青怒气未消的样子，非但没有责备反而好言相劝。
“不错，是我的主意，但这都是为你好，你想一想，离家才三年多，你就要加入邪教，把祖宗的信仰都抛掉了，叫我怎么向父母交待呢！”孙眉说得情真意切，但孙文听不进去，依然一脸不屑。
“再说，我们中国人应当接受中国式的教育。我知道你喜欢读书，那就回去选择一所好一点的学校继续上学就是了。”
孙文仅管怨气未消，但在厚貌深情的大哥面前，只好选择奉令承教。当年七月，孙文离开夏威夷回到老家翠亨村。
受了几年西方式的教育，孙文的观念已经有了明显的变化，他向村民们介绍海外的文明和繁荣，哀叹自己的家乡还是那样贫瘠和落后，泱泱大国比不上一个小岛，这一切都是因为满清统治的腐败和无能造成的。虽然这些大道理在村民中尚不能为人所理解，但从此大家便对孙文刮目相看。
孙文毕竟还是个风华少年，童心未泯，时不时会做出一些令人啼笑皆非的傻事。这次的事情闹大了。
翠亨村有一座北帝庙，那里供着一尊北帝神像，平时香火不断，逢年过节更是热闹非凡。自从孙文回国后，村里的少年朋友经常聚在一起玩耍。这一天，不知谁说起神庙里闹鬼的事，孙文一脸不屑。
“什么神呀鬼的，都是瞎编的谎话，不可信的。”孙文头一个站起来表示反对。
“真的真的，你不要瞎说，当心关帝割你的舌头。”说话的名叫陆中桂，年龄与孙文相仿，俩人私交极好。此人后来改名陆皓东，是孙文的革命同志。
“哼，我才不信呢，北帝天天站在那里，一动不动，怎么能下来割舌头呢?”孙文觉得可笑。
“北帝是神，自然有办法下来，你当心点吧。”陆中桂坚持着，虔诚地向北帝合十作揖。
“这样吧，我上去拧一下他的胳膊，如果有肉，说明他是真神，否则就是假的。”孙文不肯罢休，非要用事实来证明自己的判断。说着几步就跨到神像旁，用力把北帝的手扭了一下，只听“咔嚓”一声，神像的手臂当即断裂。众人见状吓得四处逃窜，唯有孙文还站在那里高喊：“是假的，是假的。”
消息很快传遍全村，村民们自然不会放他过门，就聚集在孙达成家门前兴师问罪。
“你们家孙文受邪教的影响太深，竟敢亵渎神像，终将给全村带来灾难，必须严惩不贷。”有人高喊着，响应者众多。
“限你们三天之内修复北帝像，否则……”喊声越来越多，孙达成有些招架不住。
“诸位乡亲，孙文造孽，理应受罚，按家规处置。北帝像由我家出钱重塑，金箔加身，望诸位放心就是。”孙文的母亲平时木讷寡言，但向来遇事不苟，对乡亲赤诚相待。村民见孙文的母亲当众承诺，也就应允而散了。
从此，孙文经常遭到父母的训斥和乡亲的责难，日子过得越来越无趣。此事不知何时传到孙眉的耳朵里，他写信来对孙文说，事已如此，引以为戒，不便久留，早日出走。
孙文和家人商量后，决定远走他乡，目标香港，因为那里离翠亨村不远。
自从1842年清政府签订的《南京条约》中承诺，将香港割让给英国之后，香港的教育逐渐走向英式。孙文首先进入英基督教圣公会所开办的拔萃书院就读，不久转入中央书院。
在拔萃书院时，他与同村好友陆皓东相处甚密，俩人不断探讨基督教义与儒家思想的差别。加之学校教育的潜移默化，孙文就在传教士喜嘉理的主持下洗礼入教，从此成为基督教徒，改名“日新”。其国文老师按“日新”的广东话发音，改号为“逸仙”。此事不经意间又传到孙眉那里，他情急之下给孙文写信，谎称自己事业失利欲东山再起，缺少人手，令他火速前往协助。孙文只好半途辍学赶赴檀香山。那是1884年11月。
到了那里，迎接他的竟是一场疾风暴雨般的同室操戈。
“我辛辛苦苦赚钱供你读书，你却瞒着我加入邪教，气死我了。”孙眉冷语冰人，对孙文严加训斥。
“我再说一遍，基督教的教义是弘扬自由、平等、爱主、爱人，怎么能说是邪教呢！”孙文辩口利辞应对自如。
“我没有功夫和你探讨这些奇谈怪论，总之，如果你还是炎黄子孙，就不可以加入基督教之类的教派。只要你安心读书，什么代价我都愿意出，但必须退出基督教。”孙眉不容分说下了死命令，丝毫没有选择的余地。孙文自小养成了特立独行的性格，对于认准的道理矢志不渝，他见个大哥如此颐指气使，自然不肯善罢甘休。
“信仰是我个人的自由，他人无权干涉，即便是大哥，同样没有这个权利。”孙文直气壮地回敬孙眉。
“好，既然你如此目无尊长，从现在起我不再支持你上学，同时，把我以前分割给你的的财产统统退还给我。”
“我孙文从不把金钱放在眼里，你要，我可以立刻与你办理退还手续。”孙文心坚石穿，不为金钱所动，“不过我告诫你，金钱是中国的祸害之一，能为家族赢得荣誉，能得到乡亲尊敬的，不只是金钱！”孙文说罢拂袖而去，把孙眉气得切齿愤盈，拉着孙文到律师那里办理财产退还手续。
事态自此并未了结，孙文怒气未消，走进孙眉的书房一把将他供奉的关帝象撕了下来，并将它扔进厕所里。如此一来孙眉被彻底激怒了，他拉着孙文的衣领便“啪啪”两记耳光，把孙文的半个脸打得肿胀起来，兄弟之情彻底决绝。
孙文愤然出走，无论何人好言相劝都不能令他回转心意，他扛着一只简单的行李箱到了檀香山的正埠。他决意要回国，即便无人资助他，也要上学读书。可是身无分文的他连回国的路费都没有，要想读书谈何容易。好在他有一个老同学正在那里谋事，经他引荐后见到了曾经相识的传教士芙兰帝文牧师，他在听了孙文的叙述后深表同情，愿意为他支付回国的路费。
“孩子，看在上帝的份上，不要记恨你的哥哥，你去吧，到你想去的地方，做你想做的事情，上帝与你同在。”
临行前，他的同学和牧师将他送到码头上依依惜别。
“我的孩子，愿你一路平安。”牧师深情地对孙文说，“我把这两部书送给你，希望你能认真阅读，将来做一个对国家有用的人。”孙文接过来一看，立即喜笑颜开，那正是他朝思暮想的《华盛顿传记》和《林肯演说集》。
“老师，谢谢您，我不会辜负您的期望，不会辜负这两部书。”孙文说完向牧师深鞠躬后，迈着坚定的步伐朝着一艘远洋巨轮走去。
孙文走后，大哥孙眉追悔莫及，他反省自己对弟弟管束过严，
以致挫伤了他的自尊心。想到孙文有理想、有抱负，聪明睿智，勤思好学，一定是个可塑之才，决心要培养他成为一个读书人。可是弟弟又是个强毅果敢、特立独行的人，如若任其自流，难免遭灾引祸、惹事生非，必将给家人带来不必要的烦恼。于是心生一计，当即给父亲寄去一大笔钱，一来供孙文上学读书，二来建议父母尽快给他娶妻成家，让家庭的藩篱来约束他，也许是再好不过的选择。
孙达成心领神会，当即着手为孙文择妻。同乡卢耀显与孙眉同为檀香山华侨，其长女卢慕贞与孙文年龄相仿，家境也般配，经双方家长商定后决定结亲。
1885年5月26日，俩人尊父母之命结婚。同年8月，孙文重赴香港中央书院复学，不久转学到香港西医书院就读，从此启用孙逸仙这个名字。
经过五年的刻苦学习，孙逸仙以优异成绩提前一年毕业。不久，澳门镜湖中医院聘他为主治医生。他走马上任后工作兢业，待人诚恳 ，为了发挥西医治长，他向医院借了一笔钱开设中西药局，收费低廉，信誉可靠，在澳门名声大震。由于澳门属于葡萄牙管辖，葡属医生对孙逸仙自然持排斥态度，他们以孙逸仙没有葡萄牙行医执照为由，逼迫当局驱逐孙逸仙，无奈之下孙逸仙只好将中西药局迁到广州，改名东西药局，并很快恢复了在澳门时的人气，孙逸仙医生的医术和医德大受赞赏。如果孙逸仙继续从医，他也许会成为一个备受尊敬的名医和富翁。但他的志向不在于此，而是要救国扶民，因而在1894年的春节前，孙逸仙抛下药局回乡,撰写文章去了。
