自从袁世凯当上临时大总统后，他的狼子野心逐渐暴露出来。他采取各种阴谋手段打击革命势力，妄图实行独裁统治。
3月20日，他派人刺杀了国民党代理事长宋教仁。宋教仁是一位高才远识的政治家，他忠肝义胆刚直不阿。为了宣传民主共和的主张，他口无择言身无择行，评时论政切中时弊，袁世凯将他看作眼中钉肉中刺，在一次外出公务时，被袁世凯派出的枪手刺杀在上海火车站。
孙中山在宋教仁被刺的第二天才得知这一消息，当时他正准备从东京出发经横滨等地直达长崎，那是他的好兄弟梅屋庄吉的家乡，长崎市已为迎接孙中山的到来作了空前的准备。
“袁世凯这个卑鄙无耻的小人，终于等不及了，急于下毒手了。”孙中山怒不可遏，居然拍起桌子来了，这在他的生活中是极为少见的。
“先生，我看这只是一个信号，有消息说，他已经下了密令准备武装消灭国民党。”孙中山的随行人员马君武报告说。
孙中山听后点了点头，未作任何表示。
“他瞒天昧地大举外债购买武器，显然是在为发动内战作准备，我们不得不防呀! ” 宋嘉树在财经界有许多朋友，消息十分灵通，此时也不失时机提醒孙中山。
“这是头中山狼，秉性难移呀！我把他估计得太高了。”孙中山很后悔当初对袁世凯一片诚意，想不到他百约百叛负德辜恩，最终与革命党人背道而驰，这不是一起孤立的事件，背后一定隐藏着巨大的阴谋，“嘉树兄，我们受到袁世凯的愚弄，他居然蔑视当初的临时约法，背叛革命的意向十分清楚，所以，只有一条路可走，那就是尽快武装倒袁。”孙中山显然决心已定，所以言辞激昂态度坚决。
大家也都表示了类似的看法。
“那么，就请把后面的活动统统取消，我们立即回国筹划倒袁斗争。”孙中山下了命令，随行人员就着手安排。2月25日，孙中山一行坐船赶回上海。
不料在讨袁问题上，国民党内部发生分歧，一派主张武装讨伐，一派主张通过法律程序弹劾袁世凯，双方各持己见，争论不休。
袁世凯并非等闲之辈，他是按照自己的思维逻辑行事的。6月，他先发制人，首先罢免了国民党籍的三省都督，并下令北洋军南下攻打南京临时政府的辖地，迫使国民党中的革命派揭竿而起。7月12日，李烈钧在江西宣布独立，接着发兵讨伐袁世凯，南方各省也相继独立举兵讨袁，二次革命随即爆发。
然而，袁世凯在帝国主义列强的支持下羽翼已丰，军事实力大为增强，双方激战两个月，二次革命又以失败告终。孙中山被迫离开上海退避台湾。此时袁世凯以晋官和赏银十万两为奖励，密电海军诱捕孙中山后处死沉海。为此，大家商议认为，孙中山还是先到日本避难为好。
孙中山听从大家的意见，就坐上他的日本朋友郡宽四郎的船前往日本。在快到神户港时，突然遇到日本水上警察的检查。
“先生，您不必紧张，先躲在这里，我去应付他们，您绝对不要出声。”说着，郡宽四郎将孙中山送到一间小屋里，随后轻轻地关上门。这个小屋在楼梯的角落里，非常小，看起来像间浴室。
船长走出小屋，看到事务长和神户水上警署的警官站在那里。
“请问，有什么事吗？”郡宽四郎若无其事地问道。
“我们在找一个姓孙的乘客。”警官答道，他大约有四十多岁的样子。
“姓孙？我怎么不记得有这个人呢。有什么要紧的事吗？“
“我这里有一张禁止令，内务省警察局接到孙已到你们船上逃命的报告。他是中国的前大总统，船长有没有将他藏起来？”警官有些不客气。
“没有！”郡宽四郎很生气，“孙大总统，以前他作为国宾被政府接待的时候我见到过，如果他上船，我应当知道的。”他平静地回答说，顺手将船长室的门打开让警官进来。“我把乘客的名单交给你，如果还有怀疑，就请搜查好了。”
“好吧，我们边看名单边搜查可以吗？”警官接过名单扫视一眼后问道。
“当然可以。”郡宽四郎答应着，并把一等航海师以下的人召集起来命令说，“请各位协助警察搜查，这是公务，不得懈怠。”
不仅如此，他还把自己的办公室作为搜查指挥部，并且吩咐端来茶水。
警察分成四路开始搜查，化了三个小时，除了那间小屋，他们查遍全船各个舱室，一无所获。
“对不起，船长，我们确实接到命令，但……打扰您了。”警察无奈地向船长行个礼退下了。待警察离船后，郡宽四郎才打开小屋的门。
“先生，这次躲过了搜查，下一个目的地不知会怎样。警察虽已离船，但依旧心存怀疑，还得多加小心。”船长将自己的担心说给孙中山听。
“亡命是革命者不可避免的命运，走一步看一步。”孙中山坦荡地答道。
孙中山亡命之事很快传了出来，许多日本志士发起营救活动，梅屋庄吉当然不会袖手旁观，他与萱野长知等人商量后，制定出一个金蝉脱壳之计。于是他们先租用一条小船，待大船在横滨港停泊前避开大批记者的追踪，用小船将孙中山接到岸上。此时，梅屋庄吉开着自家车在岸上迎候，待孙中山一上岸，立即坐上庄吉的车向东京飞驶而去。而另有一辆车是头山满派来的，上面坐着几名彪形大汉做保镖，护送孙中山一路顺行到东京赤坂头山满的家里。此时已是8月18日的清晨。
为了防范袁世凯的刺客前来追杀，头山满又迅速将孙中山转移到他的好友海猪勇彦的家里，他们两家紧挨着，一家是二十六号，一家是二十七号，两家的后院是相通的，所以对外就说是住在头山满家，实际上住在海猪勇彦家里。到了晚上，梅屋庄吉用车将孙中山接到自己家中。从此，孙中山不辞辛劳积极筹划讨袁的第三次革命。
孙中山住在庄吉家，对外联络都由庄吉负责。头山满门下有四、五个勇士长期住在庄吉家里，名义上是研修生，实际上都是孙中山的保镖。庄吉本人在家时从来都是枪不离身。
由于日本各界朋友的不懈努力，迫使日本政府默认了这一事实，如果政府将这一消息透露给袁世凯的情报机构，孙中山定有遭到暗杀的危险。
